IVe siècle Construction de la première chapelle par Saint Urbain, évêque de Langres.
Ve siècle L'église devient une paroisse.
XVe siècle Reconstruction de la paroisse qui devient une collégiale de chanoines.
1789 À la Révolution, l'église devient un bien national et sert alors de marché.
1803 Le 1er projet de faire de Saint-Jean une salle de spectacle est proposé par l'architecte Antoine.La municipalité préfère utiliser l'édifice pour en faire une halle de boucheries.
1807 Saint-Jean sert d'entrepôt pour les vins.
1823-1838 L'Armée s'installe à Saint-Jean et en fait un magasin de fourrage.
1838-1858 Saint-Jean devient un marché couvert, le Marché du Midi, avant d'être utilisé comme un entrepôt pour les farines des boulangers dijonnais.
1862 L'église est classée Monument historique.
1865 Elle redevient un lieu de culte jusqu'en 1973, date à laquelle elle est désacralisée.
1974 Saint-Jean accueille le Centre Dramatique National de Bourgogne.